Во-первых, положение перекрута разное (в начале или середине шлейфа), иногда даже есть два перекрута. Распространённое мнение, что в конец ставится А:, а в середину В: на этом легко обламывается. Чаще всего странности бывают на шлейфах под 3,5+5,25 одновременно.
Во-вторых, можно нарваться на MFM шлейф. Уже выше подметили. Перекрут на других проводах.
В-третьих, бывают шлейфы без перекрута совсем. Там дисководы А и В выставляются только перемычками. Самое весёлое потом такой дисковод ставить в машину с обычным шлейфом, не посмотрев на перемычки.